Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsf1E9PWW9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsf1E9PWW9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms