Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931408C20RikE9PWP9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931408C20RikE9PWP9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms