Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syde2E9PUP1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syde2E9PUP1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms