Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Soga1E1U8D0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Soga1E1U8D0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms