Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cngb1E1AZ71 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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