Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn2r49D3Z6L3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn2r49D3Z6L3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms