Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3543D3Z235 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3543D3Z235 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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