Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms