Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cspp1B2RX88 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms