Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Siah3B2RWG3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Siah3B2RWG3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms