Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zscan5bB2RTN3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms