Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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