Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpb1B2RS76 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpb1B2RS76 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms