Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brpf1B2RRD7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms