Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Phf3B2RQG2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Phf3B2RQG2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms