Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm2012B1B0R1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms