Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ssxa1B1AUS7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssxa1B1AUS7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms