Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttll6A4Q9E8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll6A4Q9E8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms