Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CatsperbA2RTF1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms