Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf39A2RT81 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf39A2RT81 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms