Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc163A2AGD7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms