Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cdc27A2A6Q5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cdc27A2A6Q5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms