Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm27029A2A4P4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms