Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cul4bA2A432 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms