Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms