Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv19A0A0B4J1H4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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