Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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