Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W9

Ighv1-58, Immunoglobulin heavy variable 1-58 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-58A0A075B5W9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ighv1-58A0A075B5W9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ighv1-58A0A075B5W9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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