Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrit3W8DXL4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrit3W8DXL4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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