Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ubl3Q9Z2M6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms