Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mbd1Q9Z2E2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms