Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip6Q9Z1Y4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms