Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pmfbp1Q9WVQ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms