Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VapaQ9WV55 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VapaQ9WV55 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms