Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms