Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lemd3Q9WU40 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lemd3Q9WU40 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms