Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkraQ9WTX2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PrkraQ9WTX2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms