Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam50bQ9WTJ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam50bQ9WTJ8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms