Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tpk1Q9R0M5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tpk1Q9R0M5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms