Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsjQ9R014 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms