Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnf4Q9QZS2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf4Q9QZS2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms