Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc3Q9QZC1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc3Q9QZC1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms