Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf11Q9QYK7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf11Q9QYK7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms