Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Plxnb3Q9QY40 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Plxnb3Q9QY40 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms