Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxe3Q9QY14 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxe3Q9QY14 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms