Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cbx8Q9QXV1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cbx8Q9QXV1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms