Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trp53inp1Q9QXE4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trp53inp1Q9QXE4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms