Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Limd1Q9QXD8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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Limd1Q9QXD8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limd1Q9QXD8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limd1Q9QXD8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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