Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trpc5Q9QX29 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms