Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms